期作中進行管路保養
可確保管路系統正常運作，減少阻塞問題。
管路沖洗：浸潤過後，以強力大量清水，藉由多次震動，先沖洗主管由末端排出沉積雜物，需將支管關閉；接著再逐一或多支沖洗支管，但主管末端要關閉。以清水沖洗管路（依主管、支管順序沖洗）須有充足之壓力方可將管內之沉澱物沖出。例如支管沖洗時應有20-50公分長度之水柱才達到標準，如此可決定每次馬達起動時應打開之支管管閥數量。

期作結束管路清理
以濃鹽酸12.3N稀釋100倍（0.123N），用量每分地約400公升。將稀釋後濃鹽酸抽入管內，使滴灌管內部充滿濃鹽酸，應特別注意，抽入濃鹽酸後馬達要立即以清水沖洗乾淨，以免馬達發生生鏽卡死問題，但清水絕對不可再流入水管及滴管內，以免濃鹽酸被稀釋沖淡，浸潤時間為24~48小時（若提高濃度，則時間可縮短）。